Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms