Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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