Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BEST4Q8NFU0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BEST4Q8NFU0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEST4Q8NFU0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BEST4Q8NFU0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BEST4Q8NFU0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEST4Q8NFU0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEST4Q8NFU0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEST4Q8NFU0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEST4Q8NFU0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BEST4Q8NFU0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEST4Q8NFU0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEST4Q8NFU0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEST4Q8NFU0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEST4Q8NFU0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEST4Q8NFU0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEST4Q8NFU0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEST4Q8NFU0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEST4Q8NFU0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BEST4Q8NFU0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST4Q8NFU0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST4Q8NFU0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEST4Q8NFU0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BEST4Q8NFU0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEST4Q8NFU0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BEST4Q8NFU0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BEST4Q8NFU0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEST4Q8NFU0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BEST4Q8NFU0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BEST4Q8NFU0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BEST4Q8NFU0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST4Q8NFU0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEST4Q8NFU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEST4Q8NFU0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BEST4Q8NFU0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEST4Q8NFU0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEST4Q8NFU0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEST4Q8NFU0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEST4Q8NFU0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST4Q8NFU0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST4Q8NFU0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEST4Q8NFU0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEST4Q8NFU0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST4Q8NFU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST4Q8NFU0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST4Q8NFU0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST4Q8NFU0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST4Q8NFU0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST4Q8NFU0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST4Q8NFU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST4Q8NFU0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST4Q8NFU0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST4Q8NFU0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST4Q8NFU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST4Q8NFU0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST4Q8NFU0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST4Q8NFU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEST4Q8NFU0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEST4Q8NFU0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST4Q8NFU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST4Q8NFU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST4Q8NFU0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEST4Q8NFU0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST4Q8NFU0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST4Q8NFU0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST4Q8NFU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST4Q8NFU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST4Q8NFU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST4Q8NFU0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST4Q8NFU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST4Q8NFU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms