Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms