Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC1A1P43005 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms