Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms