Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ARAP1Q96P48 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms