Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms