Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00588Q9Y4M8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00588Q9Y4M8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00588Q9Y4M8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms