Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
WASHC2CQ9Y4E1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms