Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF330Q9Y3S2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZNF330Q9Y3S2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF330Q9Y3S2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF330Q9Y3S2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms