Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms