Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFSF13BQ9Y275 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF13BQ9Y275 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms