Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML2Q9UQR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML2Q9UQR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML2Q9UQR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML2Q9UQR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML2Q9UQR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms