Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FZD1Q9UP38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FZD1Q9UP38 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FZD1Q9UP38 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FZD1Q9UP38 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms