Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP1B4Q9UN42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP1B4Q9UN42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP1B4Q9UN42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP1B4Q9UN42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATP1B4Q9UN42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP1B4Q9UN42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP1B4Q9UN42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP1B4Q9UN42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP1B4Q9UN42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP1B4Q9UN42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATP1B4Q9UN42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms