Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX20Q9UHI6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX20Q9UHI6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms