Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLKQ9UBT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLKQ9UBT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLKQ9UBT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLKQ9UBT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms