Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1BQ9P298 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1BQ9P298 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms