Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms