Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L2Q9NZM6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L2Q9NZM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms