Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 310□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.948e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-205ENST00000522848 1130 ntTSL 222.93■■□□□ 1.269e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.799e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.479e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.399e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-204ENST00000507505 1009 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC12.99□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 531.13■■■□□ 2.579e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.759e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.729e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 524.02■■□□□ 1.449e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-212ENST00000477331 1041 ntTSL 220.38■□□□□ 0.859e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.849e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 216.98■□□□□ 0.319e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 214.93□□□□□ -0.029e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-ARHGAP8-203ENST00000495250 1271 ntTSL 214.74□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 25.6
SLTMQ9NWH9 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 328.74■■■□□ 2.197e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.167e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.847e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 226.39■■□□□ 1.827e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.817e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)24.55■■□□□ 1.527e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 224.34■■□□□ 1.497e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.477e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.477e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 223.33■■□□□ 1.337e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.037e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 521.36■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.97e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CLIP2-206ENST00000487091 989 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-8■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 218.98■□□□□ 0.637e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-220ENST00000483165 603 ntTSL 418.88■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 218.33■□□□□ 0.537e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ITGA1-202ENST00000504086 1366 ntTSL 218.31■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-8■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CCDC85C-206ENST00000557576 656 ntTSL 216.6■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PELO-202ENST00000506949 888 ntTSL 216.44■□□□□ 0.227e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 UPF1-204ENST00000596842 3825 ntTSL 216.23■□□□□ 0.197e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.127e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 315.76■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 215.71■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CRIM1-203ENST00000426856 667 ntTSL 315.67■□□□□ 0.17e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 215.23■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 214.96□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.045e-8■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 DBNL-204ENST00000432854 9618 ntTSL 513.81□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CLIP2-209ENST00000493166 561 ntTSL 413.28□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.447e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 GALNS-210ENST00000567779 546 ntTSL 311.28□□□□□ -0.67e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 CRIM1-204ENST00000428774 700 ntTSL 311.23□□□□□ -0.617e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 49.36□□□□□ -0.917e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.167e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.616e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)21.3■■□□□ 16e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.019e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.949e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.799e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-206ENST00000432186 905 ntTSL 218.3■□□□□ 0.529e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.389e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.39e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 514.97□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 UBE2I-212ENST00000566159 2642 nt16.83■□□□□ 0.291e-9■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 UBE2I-211ENST00000564143 444 ntTSL 314.02□□□□□ -0.177e-10■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.93e-7■■■■□ 25.5
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 421.73■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 316.84■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 315.7■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 412.88□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.194e-7■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.314e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-12■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 25.68□□□□□ -1.56e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 LRMDA-210ENST00000593817 221 ntTSL 35.15□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.015e-7■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.955e-7■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 MNX1-206ENST00000479817 169 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.935e-7■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 25.4
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