RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.95■■■■■ 8.47
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.57■■■■■ 7.29
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC9O60706 1549 aa59.92■■■■■ 7.18
FAAP20-210ENST00000440825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.31■■■■■ 6.77
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.27■■■■■ 6.76
FAAP20-210ENST00000440825 NACADO15069 1562 aa57.08■■■■■ 6.73
FAAP20-210ENST00000440825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.49■■■■■ 6.63
FAAP20-210ENST00000440825 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.45■■■■■ 6.63
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.07■■■■■ 6.57
FAAP20-210ENST00000440825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.03■■■■■ 6.56
FAAP20-210ENST00000440825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.96■■■■■ 6.55
FAAP20-210ENST00000440825 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.57■■■■■ 6.49
FAAP20-210ENST00000440825 SCRIBQ14160 1630 aa55.41■■■■■ 6.46
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.38■■■■■ 6.46
FAAP20-210ENST00000440825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.81■■■■■ 6.37
FAAP20-210ENST00000440825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.17■■■■■ 6.26
FAAP20-210ENST00000440825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.11■■■■■ 6.25
FAAP20-210ENST00000440825 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.84■■■■■ 6.21
FAAP20-210ENST00000440825 SMARCA4P51532 1647 aa52.86■■■■■ 6.05
FAAP20-210ENST00000440825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.7■■■■■ 6.03
FAAP20-210ENST00000440825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.67■■■■■ 6.02
FAAP20-210ENST00000440825 NCAPD3P42695 1498 aa52.66■■■■■ 6.02
FAAP20-210ENST00000440825 SMARCA2P51531 1590 aa52.58■■■■■ 6.01
FAAP20-210ENST00000440825 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.41■■■■■ 5.98
FAAP20-210ENST00000440825 HMGXB3Q12766 1538 aa52.36■■■■■ 5.97
FAAP20-210ENST00000440825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.27■■■■■ 5.96
FAAP20-210ENST00000440825 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.23■■■■■ 5.95
FAAP20-210ENST00000440825 WIZO95785 1651 aa51.86■■■■■ 5.89
FAAP20-210ENST00000440825 ERCC6Q03468 1493 aa51.7■■■■■ 5.87
FAAP20-210ENST00000440825 NESP48681 1621 aa51.69■■■■■ 5.87
FAAP20-210ENST00000440825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.61■■■■■ 5.85
FAAP20-210ENST00000440825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.38■■■■■ 5.82
FAAP20-210ENST00000440825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
FAAP20-210ENST00000440825 CUX2O14529 1486 aa51.18■■■■■ 5.78
FAAP20-210ENST00000440825 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.16■■■■■ 5.78
FAAP20-210ENST00000440825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.09■■■■■ 5.77
FAAP20-210ENST00000440825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.05■■■■■ 5.76
FAAP20-210ENST00000440825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.93■■■■■ 5.74
FAAP20-210ENST00000440825 CFTRP13569 1480 aa50.72■■■■■ 5.71
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.65■■■■■ 5.7
FAAP20-210ENST00000440825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.62■■■■■ 5.69
FAAP20-210ENST00000440825 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.61■■■■■ 5.69
FAAP20-210ENST00000440825 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.6■■■■■ 5.69
FAAP20-210ENST00000440825 WDR62O43379 1518 aa50.41■■■■■ 5.66
FAAP20-210ENST00000440825 PRDM2Q13029 1718 aa50.31■■■■■ 5.64
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.21■■■■■ 5.63
FAAP20-210ENST00000440825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.17■■■■■ 5.62
FAAP20-210ENST00000440825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.62
FAAP20-210ENST00000440825 TOPBP1Q92547 1522 aa49.74■■■■■ 5.55
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC8Q09428 1581 aa49.64■■■■■ 5.54
FAAP20-210ENST00000440825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.62■■■■■ 5.53
FAAP20-210ENST00000440825 IFT140Q96RY7 1462 aa49.52■■■■■ 5.52
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.39■■■■■ 5.5
FAAP20-210ENST00000440825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.28■■■■■ 5.48
FAAP20-210ENST00000440825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
FAAP20-210ENST00000440825 CUX1P39880 1505 aa49.19■■■■■ 5.47
FAAP20-210ENST00000440825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
FAAP20-210ENST00000440825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.14■■■■■ 5.46
FAAP20-210ENST00000440825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.12■■■■■ 5.45
FAAP20-210ENST00000440825 SOGA1O94964 1423 aa49.1■■■■■ 5.45
FAAP20-210ENST00000440825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.08■■■■■ 5.452e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-210ENST00000440825 OSCARQ8IYS5 282 aa49.06■■■■■ 5.44
FAAP20-210ENST00000440825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
FAAP20-210ENST00000440825 FBLN2P98095 1184 aa48.72■■■■■ 5.39
FAAP20-210ENST00000440825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.71■■■■■ 5.39
FAAP20-210ENST00000440825 WDR97A6NE52 1622 aa48.69■■■■■ 5.39
FAAP20-210ENST00000440825 CHD1O14646 1710 aa48.66■■■■■ 5.38
FAAP20-210ENST00000440825 SYNJ1O43426 1573 aa48.63■■■■■ 5.38
FAAP20-210ENST00000440825 TOP2BQ02880 1626 aa48.61■■■■■ 5.37
FAAP20-210ENST00000440825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.61■■■■■ 5.37
FAAP20-210ENST00000440825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.6■■■■■ 5.37
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM41Q8WV44 630 aa48.58■■■■■ 5.37
FAAP20-210ENST00000440825 GRIN2BQ13224 1484 aa48.55■■■■■ 5.36
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.55■■■■■ 5.36
FAAP20-210ENST00000440825 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.52■■■■■ 5.36
FAAP20-210ENST00000440825 PBRM1Q86U86 1689 aa48.46■■■■■ 5.35
FAAP20-210ENST00000440825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.44■■■■■ 5.35
FAAP20-210ENST00000440825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.42■■■■■ 5.34
FAAP20-210ENST00000440825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.32■■■■■ 5.33
FAAP20-210ENST00000440825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.32■■■■■ 5.33
FAAP20-210ENST00000440825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.32■■■■■ 5.33
FAAP20-210ENST00000440825 SYNJ2O15056 1496 aa48.29■■■■■ 5.32
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF11O15085 1522 aa48.25■■■■■ 5.31
FAAP20-210ENST00000440825 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.04■■■■■ 5.28
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS12P58397 1594 aa48.01■■■■■ 5.28
FAAP20-210ENST00000440825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.97■■■■■ 5.27
FAAP20-210ENST00000440825 GRIN2AQ12879 1464 aa47.93■■■■■ 5.26
FAAP20-210ENST00000440825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.93■■■■■ 5.26
FAAP20-210ENST00000440825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.91■■■■■ 5.26
FAAP20-210ENST00000440825 ARAP1Q96P48 1450 aa47.83■■■■■ 5.25
FAAP20-210ENST00000440825 CEP170Q5SW79 1584 aa47.73■■■■■ 5.23
FAAP20-210ENST00000440825 KIF27Q86VH2 1401 aa47.73■■■■■ 5.23
FAAP20-210ENST00000440825 NUP160Q12769 1436 aa47.69■■■■■ 5.22
FAAP20-210ENST00000440825 IGF1RP08069 1367 aa47.56■■■■■ 5.2
FAAP20-210ENST00000440825 CUL7Q14999 1698 aa47.46■■■■■ 5.19
FAAP20-210ENST00000440825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.44■■■■■ 5.18
FAAP20-210ENST00000440825 SHROOM2Q13796 1616 aa47.37■■■■■ 5.17
FAAP20-210ENST00000440825 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.32■■■■■ 5.17
FAAP20-210ENST00000440825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.31■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180 ms