RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.2■■■■■ 6.91
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52■■■■■ 5.92
FAAP20-201ENST00000378543 ABCC9O60706 1549 aa51.54■■■■■ 5.84
FAAP20-201ENST00000378543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.25■■■■■ 5.47
FAAP20-201ENST00000378543 NACADO15069 1562 aa49.03■■■■■ 5.44
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.91■■■■■ 5.42
FAAP20-201ENST00000378543 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.5■■■■■ 5.35
FAAP20-201ENST00000378543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
FAAP20-201ENST00000378543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.22■■■■■ 5.31
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.08■■■■■ 5.29
FAAP20-201ENST00000378543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.06■■■■■ 5.28
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.91■■■■■ 5.26
FAAP20-201ENST00000378543 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.84■■■■■ 5.25
FAAP20-201ENST00000378543 SCRIBQ14160 1630 aa47.45■■■■■ 5.19
FAAP20-201ENST00000378543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.16■■■■■ 5.14
FAAP20-201ENST00000378543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
FAAP20-201ENST00000378543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.58■■■■■ 5.05
FAAP20-201ENST00000378543 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.35■■■■■ 5.01
FAAP20-201ENST00000378543 SMARCA4P51532 1647 aa45.3■■■■■ 4.84
FAAP20-201ENST00000378543 NCAPD3P42695 1498 aa45.26■■■■■ 4.84
FAAP20-201ENST00000378543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
FAAP20-201ENST00000378543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
FAAP20-201ENST00000378543 SMARCA2P51531 1590 aa45.1■■■■■ 4.81
FAAP20-201ENST00000378543 HMGXB3Q12766 1538 aa44.97■■■■■ 4.79
FAAP20-201ENST00000378543 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.87■■■■■ 4.77
FAAP20-201ENST00000378543 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.84■■■■■ 4.77
FAAP20-201ENST00000378543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
FAAP20-201ENST00000378543 NESP48681 1621 aa44.43■■■■■ 4.7
FAAP20-201ENST00000378543 ERCC6Q03468 1493 aa44.42■■■■■ 4.7
FAAP20-201ENST00000378543 WIZO95785 1651 aa44.38■■■■■ 4.69
FAAP20-201ENST00000378543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.17■■■■■ 4.66
FAAP20-201ENST00000378543 CUX2O14529 1486 aa44.16■■■■■ 4.66
FAAP20-201ENST00000378543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
FAAP20-201ENST00000378543 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.91■■■■■ 4.62
FAAP20-201ENST00000378543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.89■■■■■ 4.62
FAAP20-201ENST00000378543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.87■■■■■ 4.61
FAAP20-201ENST00000378543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
FAAP20-201ENST00000378543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.59■■■■■ 4.57
FAAP20-201ENST00000378543 CFTRP13569 1480 aa43.52■■■■■ 4.56
FAAP20-201ENST00000378543 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.48■■■■■ 4.55
FAAP20-201ENST00000378543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.42■■■■■ 4.54
FAAP20-201ENST00000378543 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.41■■■■■ 4.54
FAAP20-201ENST00000378543 WDR62O43379 1518 aa43.36■■■■■ 4.53
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.32■■■■■ 4.53
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM2Q13029 1718 aa43.18■■■■■ 4.5
FAAP20-201ENST00000378543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
FAAP20-201ENST00000378543 TOPBP1Q92547 1522 aa42.66■■■■■ 4.42
FAAP20-201ENST00000378543 ABCC8Q09428 1581 aa42.57■■■■■ 4.41
FAAP20-201ENST00000378543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
FAAP20-201ENST00000378543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.55■■■■■ 4.4
FAAP20-201ENST00000378543 IFT140Q96RY7 1462 aa42.52■■■■■ 4.4
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
FAAP20-201ENST00000378543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
FAAP20-201ENST00000378543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
FAAP20-201ENST00000378543 OSCARQ8IYS5 282 aa42.24■■■■■ 4.35
FAAP20-201ENST00000378543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
FAAP20-201ENST00000378543 CUX1P39880 1505 aa42.13■■■■■ 4.33
FAAP20-201ENST00000378543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.11■■■■■ 4.33
FAAP20-201ENST00000378543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.332e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-201ENST00000378543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.07■■■■■ 4.33
FAAP20-201ENST00000378543 SOGA1O94964 1423 aa42.07■■■■■ 4.33
FAAP20-201ENST00000378543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM41Q8WV44 630 aa41.9■■■■■ 4.3
FAAP20-201ENST00000378543 CHD1O14646 1710 aa41.85■■■■■ 4.29
FAAP20-201ENST00000378543 WDR97A6NE52 1622 aa41.82■■■■■ 4.29
FAAP20-201ENST00000378543 FBLN2P98095 1184 aa41.72■■■■■ 4.27
FAAP20-201ENST00000378543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.69■■■■■ 4.26
FAAP20-201ENST00000378543 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
FAAP20-201ENST00000378543 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
FAAP20-201ENST00000378543 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
FAAP20-201ENST00000378543 GRIN2BQ13224 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.59■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF11O15085 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.57■■■■■ 4.25
FAAP20-201ENST00000378543 PBRM1Q86U86 1689 aa41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-201ENST00000378543 SYNJ1O43426 1573 aa41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.52■■■■■ 4.24
FAAP20-201ENST00000378543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
FAAP20-201ENST00000378543 SYNJ2O15056 1496 aa41.44■■■■■ 4.22
FAAP20-201ENST00000378543 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
FAAP20-201ENST00000378543 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.25■■■■■ 4.19
FAAP20-201ENST00000378543 ARAP1Q96P48 1450 aa41.21■■■■■ 4.19
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS12P58397 1594 aa41.16■■■■■ 4.18
FAAP20-201ENST00000378543 GRIN2AQ12879 1464 aa41.11■■■■■ 4.17
FAAP20-201ENST00000378543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
FAAP20-201ENST00000378543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
FAAP20-201ENST00000378543 CEP170Q5SW79 1584 aa40.96■■■■■ 4.15
FAAP20-201ENST00000378543 NUP160Q12769 1436 aa40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-201ENST00000378543 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
FAAP20-201ENST00000378543 KIF27Q86VH2 1401 aa40.76■■■■■ 4.11
FAAP20-201ENST00000378543 SHROOM2Q13796 1616 aa40.73■■■■■ 4.11
FAAP20-201ENST00000378543 IGF1RP08069 1367 aa40.7■■■■■ 4.11
FAAP20-201ENST00000378543 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-201ENST00000378543 CUL7Q14999 1698 aa40.6■■■■■ 4.09
FAAP20-201ENST00000378543 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.57■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms