Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 STRADA-234ENST00000639135 914 ntTSL 58.57□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-210ENST00000579318 1307 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 LEMD2-210ENST00000512368 544 ntTSL 47.22□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-207ENST00000475549 297 ntTSL 27□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-209ENST00000486618 711 ntTSL 36.46□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-245ENST00000640183 2378 ntTSL 55.58□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-214ENST00000580039 998 ntTSL 55.5□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.046e-9■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 UBR4-217ENST00000497018 183 ntTSL 31.46□□□□□ -2.181e-7■■■■■ 41.1
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RBM22Q9NW64 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 211.66□□□□□ -0.546e-11■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 210.17□□□□□ -0.786e-11■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 USP7-221ENST00000570256 591 ntTSL 37.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 USP7-217ENST00000567329 567 ntTSL 46.73□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 AKAP8L-216ENST00000599488 514 ntTSL 420.44■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 41.1
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RBM22Q9NW64 AKAP8L-210ENST00000596195 553 ntTSL 48.42□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.053e-10■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.273e-10■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 41
RBM22Q9NW64 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.224e-50■■■■■ 41
RBM22Q9NW64 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 41
RBM22Q9NW64 WDR90-224ENST00000552943 5498 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 40.9
RBM22Q9NW64 WDR90-218ENST00000550739 399 ntTSL 516.62■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 40.9
RBM22Q9NW64 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 216.03■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 40.9
RBM22Q9NW64 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 40.9
RBM22Q9NW64 WDR90-212ENST00000548844 472 ntTSL 314.41□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 40.9
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RBM22Q9NW64 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 40.7
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RBM22Q9NW64 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.28e-10■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.128e-10■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 214.35□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.128e-10■■■■■ 40.7
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RBM22Q9NW64 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 211.89□□□□□ -0.518e-10■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 SHMT2-220ENST00000555634 964 ntTSL 511.4□□□□□ -0.588e-10■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.628e-10■■■■■ 40.7
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RBM22Q9NW64 CRNDE-202ENST00000502066 659 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.581e-9■■■■■ 40.7
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RBM22Q9NW64 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 40.7
RBM22Q9NW64 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 40.5
RBM22Q9NW64 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 40.5
RBM22Q9NW64 CNOT1-219ENST00000569882 831 ntTSL 34.84□□□□□ -1.636e-9■■■■■ 40.5
RBM22Q9NW64 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 526.05■■□□□ 1.761e-11■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 315.32■□□□□ 0.041e-11■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RPA2-204ENST00000419958 554 ntTSL 35.72□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 POLRMT-206ENST00000590709 1106 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 414.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 412.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 28.07□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.961e-8■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.433e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 FNBP4-215ENST00000542975 577 ntTSL 417.7■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 517.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 317.04■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 40.4
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