Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3BQ9NW08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms