Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCP11L1Q9NUJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCP11L1Q9NUJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms