Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SALL1Q9NSC2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL1Q9NSC2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL1Q9NSC2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms