Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO5Q9H790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO5Q9H790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms