Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHX3Q9H6B9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHX3Q9H6B9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHX3Q9H6B9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms