Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Y6

SRMS, Tyrosine-protein kinase Srms, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMSQ9H3Y6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRMSQ9H3Y6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRMSQ9H3Y6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRMSQ9H3Y6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRMSQ9H3Y6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRMSQ9H3Y6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRMSQ9H3Y6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRMSQ9H3Y6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRMSQ9H3Y6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms