Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT4Q9C0J1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms