Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CIPCQ9C0C6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms