Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAIPQ9BWF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAIPQ9BWF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAIPQ9BWF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms