Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf16Q9BUW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf16Q9BUW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms