Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM47Q9BQJ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM47Q9BQJ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM47Q9BQJ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM47Q9BQJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms