Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3RQ99062 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3RQ99062 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms