Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN3Q96TC7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN3Q96TC7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RMDN3Q96TC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms