Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM209Q96SK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM209Q96SK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM209Q96SK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms