Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP1Q96S65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP1Q96S65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms