Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP4Q96MN2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP4Q96MN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP4Q96MN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms