Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDXPQ96GD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDXPQ96GD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms