Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPTNQ96CV9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
OPTNQ96CV9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OPTNQ96CV9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
OPTNQ96CV9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms