Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD2Q96C19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD2Q96C19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD2Q96C19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD2Q96C19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms