Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMTQ93088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMTQ93088 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms