Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP133Q8WUM0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP133Q8WUM0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP133Q8WUM0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP133Q8WUM0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP133Q8WUM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP133Q8WUM0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms