Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms