Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD16

BICD2, Protein bicaudal D homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD2Q8TD16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BICD2Q8TD16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BICD2Q8TD16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BICD2Q8TD16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD2Q8TD16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD2Q8TD16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD2Q8TD16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD2Q8TD16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BICD2Q8TD16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms