Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD16

BICD2, Protein bicaudal D homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD2Q8TD16 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
BICD2Q8TD16 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
BICD2Q8TD16 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
BICD2Q8TD16 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
BICD2Q8TD16 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BICD2Q8TD16 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BICD2Q8TD16 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
BICD2Q8TD16 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BICD2Q8TD16 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BICD2Q8TD16 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BICD2Q8TD16 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BICD2Q8TD16 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BICD2Q8TD16 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BICD2Q8TD16 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BICD2Q8TD16 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BICD2Q8TD16 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BICD2Q8TD16 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BICD2Q8TD16 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BICD2Q8TD16 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BICD2Q8TD16 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BICD2Q8TD16 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
BICD2Q8TD16 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BICD2Q8TD16 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BICD2Q8TD16 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BICD2Q8TD16 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BICD2Q8TD16 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BICD2Q8TD16 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BICD2Q8TD16 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BICD2Q8TD16 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BICD2Q8TD16 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BICD2Q8TD16 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BICD2Q8TD16 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BICD2Q8TD16 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BICD2Q8TD16 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BICD2Q8TD16 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BICD2Q8TD16 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BICD2Q8TD16 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BICD2Q8TD16 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BICD2Q8TD16 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BICD2Q8TD16 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BICD2Q8TD16 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICD2Q8TD16 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICD2Q8TD16 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BICD2Q8TD16 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BICD2Q8TD16 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BICD2Q8TD16 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BICD2Q8TD16 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BICD2Q8TD16 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BICD2Q8TD16 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BICD2Q8TD16 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICD2Q8TD16 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICD2Q8TD16 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICD2Q8TD16 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICD2Q8TD16 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
BICD2Q8TD16 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BICD2Q8TD16 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BICD2Q8TD16 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BICD2Q8TD16 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
BICD2Q8TD16 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BICD2Q8TD16 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BICD2Q8TD16 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BICD2Q8TD16 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICD2Q8TD16 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICD2Q8TD16 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BICD2Q8TD16 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BICD2Q8TD16 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BICD2Q8TD16 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BICD2Q8TD16 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BICD2Q8TD16 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BICD2Q8TD16 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BICD2Q8TD16 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICD2Q8TD16 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICD2Q8TD16 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BICD2Q8TD16 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BICD2Q8TD16 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BICD2Q8TD16 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BICD2Q8TD16 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BICD2Q8TD16 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BICD2Q8TD16 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BICD2Q8TD16 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
BICD2Q8TD16 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BICD2Q8TD16 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BICD2Q8TD16 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BICD2Q8TD16 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BICD2Q8TD16 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BICD2Q8TD16 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
BICD2Q8TD16 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BICD2Q8TD16 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BICD2Q8TD16 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BICD2Q8TD16 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BICD2Q8TD16 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BICD2Q8TD16 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BICD2Q8TD16 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BICD2Q8TD16 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BICD2Q8TD16 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BICD2Q8TD16 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BICD2Q8TD16 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BICD2Q8TD16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BICD2Q8TD16 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BICD2Q8TD16 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms