Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTLL11Q8NHH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL11Q8NHH1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL11Q8NHH1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms